Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms