Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col1a2Q01149 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms