Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms