Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VegfaQ00731 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms