Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms