Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gabpb1Q00420 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gabpb1Q00420 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gabpb1Q00420 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gabpb1Q00420 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gabpb1Q00420 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gabpb1Q00420 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gabpb1Q00420 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gabpb1Q00420 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms