Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Psmb4P99026 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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