Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shc1P98083 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shc1P98083 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Shc1P98083 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shc1P98083 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Shc1P98083 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shc1P98083 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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