Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms