Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx2P81066 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx2P81066 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx2P81066 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx2P81066 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx2P81066 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx2P81066 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx2P81066 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx2P81066 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Irx2P81066 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irx2P81066 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irx2P81066 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irx2P81066 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Irx2P81066 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Irx2P81066 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irx2P81066 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Irx2P81066 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Irx2P81066 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Irx2P81066 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irx2P81066 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Irx2P81066 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Irx2P81066 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Irx2P81066 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irx2P81066 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irx2P81066 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irx2P81066 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irx2P81066 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Irx2P81066 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Irx2P81066 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Irx2P81066 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irx2P81066 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Irx2P81066 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx2P81066 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx2P81066 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx2P81066 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx2P81066 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms