Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms