Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53bp1P70399 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms