Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms