Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp3P63024 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms