Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms