Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga11P61622 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga11P61622 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga11P61622 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga11P61622 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga11P61622 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga11P61622 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga11P61622 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga11P61622 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga11P61622 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms