Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg6P61406 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg6P61406 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg6P61406 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg6P61406 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg6P61406 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg6P61406 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg6P61406 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Smg6P61406 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg6P61406 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg6P61406 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg6P61406 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg6P61406 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms