Protein–RNA interactions for Protein: P61166

Tmem258, Transmembrane protein 258, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem258P61166 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms