Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms