Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csrnp1P59054 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csrnp1P59054 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms