Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms