Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Strn4P58404 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Strn4P58404 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Strn4P58404 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Strn4P58404 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Strn4P58404 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Strn4P58404 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Strn4P58404 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Strn4P58404 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Strn4P58404 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Strn4P58404 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Strn4P58404 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Strn4P58404 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Strn4P58404 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Strn4P58404 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Strn4P58404 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Strn4P58404 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Strn4P58404 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Strn4P58404 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Strn4P58404 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Strn4P58404 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Strn4P58404 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Strn4P58404 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Strn4P58404 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Strn4P58404 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Strn4P58404 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Strn4P58404 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Strn4P58404 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Strn4P58404 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Strn4P58404 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms