Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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