Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lim2P56563 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lim2P56563 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lim2P56563 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lim2P56563 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lim2P56563 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms