Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms