Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Resp18P47939 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Resp18P47939 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Resp18P47939 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Resp18P47939 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Resp18P47939 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms