Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ItgavP43406 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ItgavP43406 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ItgavP43406 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ItgavP43406 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ItgavP43406 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ItgavP43406 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ItgavP43406 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ItgavP43406 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ItgavP43406 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ItgavP43406 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ItgavP43406 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ItgavP43406 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ItgavP43406 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ItgavP43406 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ItgavP43406 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ItgavP43406 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ItgavP43406 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ItgavP43406 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ItgavP43406 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ItgavP43406 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ItgavP43406 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ItgavP43406 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ItgavP43406 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ItgavP43406 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ItgavP43406 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ItgavP43406 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ItgavP43406 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ItgavP43406 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ItgavP43406 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ItgavP43406 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ItgavP43406 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ItgavP43406 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ItgavP43406 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ItgavP43406 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ItgavP43406 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ItgavP43406 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ItgavP43406 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ItgavP43406 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ItgavP43406 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ItgavP43406 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ItgavP43406 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ItgavP43406 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ItgavP43406 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ItgavP43406 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ItgavP43406 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ItgavP43406 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ItgavP43406 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ItgavP43406 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ItgavP43406 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ItgavP43406 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ItgavP43406 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ItgavP43406 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ItgavP43406 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ItgavP43406 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms