Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik2P39087 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik2P39087 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik2P39087 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik2P39087 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms