Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms