Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Saa4P31532 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Saa4P31532 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Saa4P31532 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Saa4P31532 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Saa4P31532 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Saa4P31532 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms