Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms