Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cd28P31041 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd28P31041 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd28P31041 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd28P31041 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd28P31041 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd28P31041 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd28P31041 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cd28P31041 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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