Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms