Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms