Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC17■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
U2af2P26369 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms