Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ggta1P23336 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ggta1P23336 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ggta1P23336 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ggta1P23336 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ggta1P23336 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ggta1P23336 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ggta1P23336 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ggta1P23336 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ggta1P23336 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ggta1P23336 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ggta1P23336 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ggta1P23336 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ggta1P23336 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ggta1P23336 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ggta1P23336 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ggta1P23336 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ggta1P23336 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ggta1P23336 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ggta1P23336 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ggta1P23336 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ggta1P23336 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ggta1P23336 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ggta1P23336 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ggta1P23336 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms