Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PparaP23204 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PparaP23204 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PparaP23204 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PparaP23204 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PparaP23204 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PparaP23204 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PparaP23204 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PparaP23204 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PparaP23204 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PparaP23204 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PparaP23204 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PparaP23204 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PparaP23204 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PparaP23204 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PparaP23204 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PparaP23204 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PparaP23204 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PparaP23204 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PparaP23204 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PparaP23204 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PparaP23204 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PparaP23204 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PparaP23204 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PparaP23204 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PparaP23204 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PparaP23204 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PparaP23204 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PparaP23204 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PparaP23204 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PparaP23204 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PparaP23204 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PparaP23204 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PparaP23204 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PparaP23204 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PparaP23204 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PparaP23204 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PparaP23204 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PparaP23204 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PparaP23204 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PparaP23204 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PparaP23204 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PparaP23204 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PparaP23204 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PparaP23204 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PparaP23204 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PparaP23204 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PparaP23204 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PparaP23204 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PparaP23204 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PparaP23204 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PparaP23204 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PparaP23204 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PparaP23204 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PparaP23204 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PparaP23204 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PparaP23204 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PparaP23204 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PparaP23204 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PparaP23204 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PparaP23204 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PparaP23204 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms