Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a2P20490 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms