Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
P18533 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
P18533 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P18533 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P18533 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P18533 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
P18533 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P18533 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
P18533 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P18533 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
P18533 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P18533 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P18533 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
P18533 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P18533 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
P18533 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
P18533 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
P18533 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P18533 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P18533 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
P18533 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P18533 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P18533 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P18533 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P18533 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
P18533 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P18533 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P18533 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P18533 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P18533 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P18533 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P18533 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
P18533 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
P18533 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P18533 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P18533 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P18533 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18533 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18533 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18533 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18533 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18533 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18533 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18533 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18533 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18533 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
P18533 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
P18533 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18533 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18533 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
P18533 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
P18533 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18533 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18533 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18533 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18533 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18533 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18533 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18533 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18533 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18533 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18533 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18533 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18533 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18533 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18533 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18533 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
P18533 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18533 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18533 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18533 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18533 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18533 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18533 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18533 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18533 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18533 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18533 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18533 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18533 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18533 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
P18533 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
P18533 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
P18533 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
P18533 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
P18533 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
P18533 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
P18533 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
P18533 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
P18533 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
P18533 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
P18533 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
P18533 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
P18533 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
P18533 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
P18533 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
P18533 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
P18533 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
P18533 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
P18533 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
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