Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrphP15331 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrphP15331 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrphP15331 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrphP15331 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrphP15331 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrphP15331 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrphP15331 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrphP15331 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrphP15331 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrphP15331 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrphP15331 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrphP15331 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrphP15331 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrphP15331 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrphP15331 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrphP15331 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrphP15331 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PrphP15331 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PrphP15331 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrphP15331 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrphP15331 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrphP15331 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrphP15331 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrphP15331 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrphP15331 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrphP15331 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrphP15331 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrphP15331 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrphP15331 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrphP15331 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrphP15331 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrphP15331 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrphP15331 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrphP15331 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrphP15331 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PrphP15331 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrphP15331 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrphP15331 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrphP15331 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrphP15331 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrphP15331 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrphP15331 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrphP15331 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrphP15331 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrphP15331 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrphP15331 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PrphP15331 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrphP15331 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrphP15331 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrphP15331 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrphP15331 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrphP15331 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrphP15331 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrphP15331 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrphP15331 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrphP15331 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrphP15331 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PrphP15331 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrphP15331 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrphP15331 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrphP15331 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrphP15331 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrphP15331 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrphP15331 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrphP15331 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrphP15331 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrphP15331 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrphP15331 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrphP15331 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrphP15331 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrphP15331 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrphP15331 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrphP15331 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrphP15331 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrphP15331 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrphP15331 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrphP15331 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrphP15331 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrphP15331 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PrphP15331 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrphP15331 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrphP15331 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrphP15331 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrphP15331 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrphP15331 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrphP15331 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrphP15331 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrphP15331 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrphP15331 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrphP15331 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrphP15331 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrphP15331 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrphP15331 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrphP15331 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrphP15331 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrphP15331 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrphP15331 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrphP15331 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrphP15331 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms