Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms