Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TtrP07309 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TtrP07309 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TtrP07309 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TtrP07309 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TtrP07309 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TtrP07309 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TtrP07309 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TtrP07309 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TtrP07309 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TtrP07309 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TtrP07309 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TtrP07309 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TtrP07309 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TtrP07309 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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TtrP07309 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TtrP07309 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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TtrP07309 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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TtrP07309 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TtrP07309 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TtrP07309 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TtrP07309 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TtrP07309 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TtrP07309 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TtrP07309 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TtrP07309 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TtrP07309 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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TtrP07309 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TtrP07309 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TtrP07309 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TtrP07309 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TtrP07309 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TtrP07309 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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TtrP07309 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TtrP07309 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TtrP07309 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TtrP07309 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
TtrP07309 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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