Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms