Protein–RNA interactions for Protein: O88978

Lrrc6, Protein tilB homolog, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc6O88978 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Lrrc6O88978 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Lrrc6O88978 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Lrrc6O88978 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Lrrc6O88978 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Lrrc6O88978 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Lrrc6O88978 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Lrrc6O88978 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Lrrc6O88978 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Lrrc6O88978 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Lrrc6O88978 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Lrrc6O88978 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Lrrc6O88978 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms