Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms