Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Col5a1O88207 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a1O88207 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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