Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top3aO70157 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Top3aO70157 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Top3aO70157 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Top3aO70157 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Top3aO70157 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Top3aO70157 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Top3aO70157 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top3aO70157 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top3aO70157 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top3aO70157 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top3aO70157 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top3aO70157 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top3aO70157 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top3aO70157 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top3aO70157 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top3aO70157 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top3aO70157 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top3aO70157 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top3aO70157 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top3aO70157 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top3aO70157 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Top3aO70157 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Top3aO70157 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Top3aO70157 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Top3aO70157 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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Top3aO70157 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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