Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Dsg2O55111 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Dsg2O55111 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Dsg2O55111 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Dsg2O55111 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Dsg2O55111 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Dsg2O55111 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Dsg2O55111 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Dsg2O55111 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Dsg2O55111 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Dsg2O55111 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Dsg2O55111 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Dsg2O55111 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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