Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc3O55013 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms