Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Tnfrsf18O35714 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Tnfrsf18O35714 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf18O35714 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms